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Dr. Fernando González Nilo
Doctor en Química, Profesor Titular de la Universidad Andrés Bello y Director del Centro de Bioinformática y Biología Integrativa (CBBI), (índice h: 33). En CBBI, el Dr. González Nilo lidera un equipo transdisciplinario de 9 investigadores principales, dedicados a desarrollar estrategias de investigación que combinen métodos computacionales que puedan ser validados experimentalmente. Bajo su liderazgo, el CBBI ha adoptado un enfoque de investigación integrado que enfatiza un ciclo iterativo de observación, modelado, simulación y validación. Este enfoque es apoyado por un sistema de computación de alto rendimiento que permite el desarrollo y uso de herramientas avanzadas de simulación molecular y bioinformática, en áreas como la bio-nanotecnología, el descubrimiento y entrega de medicamentos, la ingeniería de proteínas y la biofísica teórica. El trabajo del Dr. González Nilo en el laboratorio de Ingeniería de Proteínas del CBBI ha resultado en la obtención de tres patentes, y el trabajo en cinco patentes adicionales, actualmente en desarrollo. Su investigación también ha sido publicada en más de 150 artículos ISI y presentada en las portadas de 12 revistas científicas. El laboratorio del Dr. González colabora activamente con grupos y organizaciones nacionales e internacionales en América Latina, Estados Unidos y Europa en múltiples proyectos teórico-experimentales. Uno de los principales enfoques de investigación del equipo se centra en desarrollar e implementar métodos avanzados en simulaciones de Dinámica Molecular para analizar y caracterizar los determinantes estructurales que gobiernan la activación y conductancia de los canales de potasio y Hemicanales, en colaboración con investigadores del CINV-Chile. Otra línea de investigación en curso, es el estudio físico-químico de las nanoburbujas y sus aplicaciones en agricultura, acuicultura, biotecnología y salud humana. Además, su equipo está explorando nuevas estrategias para el diseño molecular de nanocuerpos, aprovechando técnicas como la bioinformática estructural, inteligencia artificial, termogravimetría y CryoEM. El Dr. González Nilo se desempeña como Director del Programa de Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas, de la Facultad de Ciencias de la Vida. Por último, su laboratorio cuenta con financiamiento de proyectos nacionales (Fondecyt, ECOS-ANID, FONDEF, Corfo) e internacionales (USARMY y DARPA de USA). A la fecha ha recibido distintos reconocimientos nacionales e internacionales, y ha dirigido la Tesis de más de 80 estudiantes de pre y postgrado y postdoctorados.
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Dr. José Manuel Pérez
Bioquímico y Dr. en Microbiología de la Universidad de Santiago de Chile, realizó dos posdoctorados (uno en Canadá y otro en Chile), y dirige el laboratorio de Bionanotecnología y Microbiología del CBBI (índice h:29). Sus líneas de investigación se relacionan con el estudio de la interacción de bacterias con metales (Cd, Cu, Li, y metales raros) mediante Microbiología, Bioquímica, Genética, Nanotecnología y Bioinformática, y en la búsqueda y aislamiento de microorganismos que habitan ambientes extremos, especialmente la Antártica y el desierto de Atacama. Además, su laboratorio estudia el uso de estos microorganismos para producir nanomateriales de interés biotecnológico y su aplicación en energía, biorremediación, sensing, producción de hidrógeno y como antimicrobianos. Actualmente su laboratorio cuenta con proyectos nacionales (Fondecyt, INACH, FIA) e internacionales (AFOSR y DARPA de USA), donde estudiantes de pregrado (2), magister (4), doctorado (4) y posdoctorado (2) desarrollan su investigación. A la fecha ha recibido distintos reconocimientos nacionales e internacionales, y ha dirigido la Tesis de más de 72 estudiantes y postdocs, y se desempeña como Profesor Asociado de la Universidad Andrés Bello.
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Dr. Jorge Valdés Anabalón
Bioquímico de la Universidad de Santiago de Chile y Doctor en Biotecnología de la Universidad Andrés Bello, Chile. El Dr. Valdés (índice h: 18) estudia la evolución del genoma y sus consecuencias fenotípicas en organismos con potencial biotecnológico. Su grupo utiliza herramientas de ÓMICAS y de bioinformática para desarrollar proyectos en los campos de la acuicultura, la agricultura, la bio-minería y la industria del vino. El Dr. Valdés ha dirigido profesionales de diferentes áreas incluyendo las ciencias biológicas, ciencias de la computación, ingeniería informática y bioinformática; entre ellos 2 posdoctorados, 4 tesistas de doctorado y 10 tesistas de pregrado y magíster. El Dr. Valdés ha apalancado fondos de diversas fuentes nacionales e internacionales incluyendo CORFO, FONDECYT, Iniciativa Científica Milenio, FONDEF, programa conjunto CONICYT-BMBF y actualmente desarrolla proyectos financiados por las agencias ANID de investigación asociativa y del programa FONDEF. El Dr. Valdés ha publicado más de 40 artículos científicos en revistas con comité editorial. El Dr. Valdés es Profesor Asociado en la Universidad Andrés Bello, coordinador nacional de la Red Iberoamericana de Inteligencia Artificial para Big Biodata (RiaBio) y miembro fundador de la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SOIBIO).
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Dra. Yorley Duarte Ayala
Químico de Alimentos, Máster en Ciencias Químicas de la Universidad Nacional de Colombia y Dra. en Ciencias Aplicadas de la Universidad de Talca (índice h: 10). La Dra. Duarte dirige el Laboratorio de Síntesis Química del CBBI, centrando su investigación en el diseño y síntesis de nuevas moléculas bioactivas, dirigidas a un blanco en particular. Además, para el desarrollo de su investigación, usa herramientas quimioinformáticas modernas, que le ayudan a dilucidar el comportamiento a nivel molecular de diversos compuestos, para así mejorar su afinidad. La Dra. Duarte ha sido partícipe de la ejecución de varios proyectos de ciencia aplicada, con proyección en industria agrícola, minera y de alimentos. Actualmente se desempeña como Profesor Asistente, y en el área administrativa la Dra. Duarte se desempeña como Secretaria Académica del Programa de Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas, de la Facultad de Ciencias de la Vida.
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Dr. Ignacio Díaz Franulic
Bioquímico de la Universidad de Chile y Doctor en Neurociencias de la Universidad de Valparaíso con postdoctorado en esa misma casa de estudios, financiado por ANID (índice h: 10). Actualmente se desempeña como Profesor Asistente de la Universidad Andrés Bello. En el CBBI dirige el laboratorio de Biofísica Experimental de Proteínas de Membrana del CBBI. Su grupo busca entender cómo es que ciertos canales iónicos han adquirido una exquisita sensibilidad a estímulos físicos como la temperatura, la presión o el voltaje, empleando técnicas experimentales como la electrofisiología, imágenes de calcio, aminoácidos no naturales y espectroscopía de fluorescencia. Su investigación está financiada por Fondecyt e INACH.
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Dr. Juan Ugalde Casanova
Licenciado en Ingeniería en Biotecnología Molecular de la Universidad de Chile y Doctor en Biología Marina de la Universidad de California, San Diego. El Dr. Ugalde (índice h: 23) dirige el laboratorio de Ciencias de Datos en Microbiología (Microbial Data Science) del CBBI, grupo el cual se dedica al desarrollo y aplicación de estrategias genómicas y bioinformáticas para el estudio de microorganismos, desde aislados de relevancia clínica o biotecnológica, hasta el estudio de comunidades complejas en ambientes naturales. El Dr. Ugalde ha dirigido y participado en diversos proyectos con financiamiento nacional e internacional, en donde ha participado en 46 publicaciones científicas a la fecha. Además de su experiencia acádemica, fue Director de Bioinformática de la empresa uBiome, y consultor en temas de bioinformática para diversas empresas nacionales e internacionales. Actualmente se desempeña como Profesor Asistente en el CBBI, liderando un grupo de 4 estudiantes de doctorado, 1 de magister y 1 investigador postdoctoral.
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Dra. Valeria Márquez Miranda
Ingeniero en Bioinformática y Doctora en Biotecnología de la Universidad Andrés Bello (índice h: 13). La Dra. Márquez-Miranda es Directora del Peptide Discovery and Machine Learning Lab del CBBI, especializado en Biofísica Computacional y Machine Learning. Realizó un Postdoctorado para iniciativas de la US-Army y la UNAB. Además realizó un postdoctorado en el Centro Interdisciplinario de Neurociencias de Valparaíso. Luego dirigió el equipo de Descubrimiento de Fármacos en la empresa uBiome, donde dirigió 3 Bioinformáticos y 1 Postdoc. Posteriormente, ejerció como Profesor Asistente en la Universidad Mayor (2 años) y dirigió un proyecto PAI-ANID. Actualmente la Dra. Márquez-Miranda es Profesor Asistente y dirige a tres estudiantes de pregrado (Carreras de Biología y Biotecnología). A la fecha ha participado en 27 artículos científicos donde destacan sus contribuciones en simulación molecular de proteínas transmembranales, tales como canales de K+ y hemicanales. Además es autor de 5 patentes en el campo del microbioma humano.
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Dra. Romina V. Sepulveda
Ingeniero en Bioinformática y Doctora en Biotecnología de la Universidad Andrés Bello. Posteriormente se adjudicó el proyecto FONDECYT Postdoctorado 2020, el cual fue ejecutado íntegramente en CBBI (índice h: 10). La Dra. Sepúlveda se integró como Profesora Asistente en diciembre de 2022 y lidera la línea de Biología Computacional y Aprendizaje Profundo Aplicado. Sus líneas de investigación buscan responder interrogantes en la formación y dinámica de membranas primitivas en astrobiología, a través de simulación computacional, e integrar la inteligencia artificial en el desarrollo de diversas aplicaciones en proyectos agronómicos de caracterización de patrones en cultivos. Actualmente, dirige dos tesistas de las carreras de Biología y Biotecnología, 1 tesis de magister de la Universidad Internacional de Valencia, y co-dirige 2 tesis doctorales del programa de Doctorado de Bioinformática y Biología de Sistemas.
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Dra. Hegaly Mendoza Vilches
Bioquímico de la Universidad de Santiago de Chile y Doctor en Ciencias Aplicadas de la Universidad de Talca. La Dra. Mendoza (índice h: 9) está a cargo del Laboratorio de Microscopía electrónica, equipado con un microscopio LVEM5 que permite el análisis a bajo voltaje, en modo SEM y TEM, dando apoyo a distintos proyectos asociados al estudio y caracterización de materiales biológicos y materiales inertes, entre otros. Actualmente se desempeña como Profesor Asistente de la Universidad Andrés Bello, y en el área administrativa como Directora de la carrera de Ingeniería Bioinformática, de la Facultad de Ciencias de la Vida.